L'équipe du NCIS, aux côtés du FBI et du MI6, continue sa chasse à l'homme internationale : Jacob Scott, l'espion britannique, est toujours en fuite. L'agent Fornell, quant à lui, est entre la vie et la mort, et deux anciens agents du NCIS, concernés par l'affaire quatorze ans plus tôt, sont menacés et manquent à l'appel. Gibbs et son équipe collaborent avec Tess Monroe, du FBI, et Clayton Reeves, du MI6, pour les retrouver au plus vite. Il s'agit d'une course contre la montre pour stopper Scott avant qu'il nuise à nouveau...