Les agents du NCIS enquêtent sur le meurtre d'un capitaine qui a eu lieu au centre de commandement militaire national. Les investigations les mènent à Hassan Sayegh, l'oncle biologique de l'ancien voisin de Gibbs, Phineas, désormais confié à une famille adoptive. Hassan avait tenté de pirater le système informatique du NCIS afin de trouver le jeune garçon après avoir causé l'accident de voiture de ses parents adoptifs...