Le NCIS ne parvenant toujours pas à identifier la taupe au sein de ses rangs, le sous-secrétaire de la Défense Corbin Duggan investit les bureaux et prend les commandes, laissant Hetty et Granger totalement impuissants. Ces derniers n'ont toutefois pas l'intention de rester les bras croisés et décident de se battre. La meilleure tactique à adopter dans un premier temps est de prouver l'efficacité de leur travail en se concentrant sur une nouvelle affaire sensible, liée au vol de césium dans différents hôpitaux de la ville. Ce composant pourrait bien servir à fabriquer une arme nucléaire...