La nouvelle mission de Mulder et Scully s'avère délicate. En effet, les deux agents sont chargés de filer un groupe de terroristes d'extrême droite qui se livre à un trafic d'armes et qui doit incessamment recevoir une importante livraison. Cette enquête conduit Mulder et Scully sur les traces de Krycek, un homme impitoyable qui ne leur est pas totalement inconnu. Cette fois, Mulder est bien décidé à mettre un terme définitif aux funestes agissements de ce sinistre individu. Mais la chose n'est pas si facile...