Mulder et Scully sont contactés par un agent de la CIA qui leur fournit de précieuses informations au sujet d'un tueur insaisissable, qui exécute des médecins tous génétiquement identiques. D'où vient ce meurtrier, qui semble lui-même capable de modifier son empreinte génétique à volonté ? Qui sont ces clones ? Mulder croit savoir où trouver l'un d'eux. S'il parvenait à lui mettre la main dessus avant le tueur, il pourrait peut-être enfin prouver l'existence d'un complot gouvernemental. C'est alors que Skinner lui apprend que son père cherche à le contacter. Mulder retourne dans la maison familiale. Là, il rencontre quelqu'un qu'il ne s'attendait pas à voir...