Le crash de l'avion a provoqué bien des remous. Les rumeurs, selon lesquelles il aurait été abattu par un avion de chasse, n'ont toujours pas été corroborées et l'enquête se poursuit. Mulder est persuadé que le vol 549 a été intercepté par un ovni, une théorie qui est loin d'enthousiasmer Mike Millar, le coordinateur des recherches...