Au cours d'une nouvelle mission qui la conduit en Allemagne, Sydney Bristow met - involontairement - en danger la vie d'un civil américain. La jeune agent secret s'en veut et décide de tout entreprendre afin de réparer son erreur et de sortir d'affaire cet innocent. Un tel événement dramatique pourrait de surcroît occasionner de très graves répercussions pour Sydney. Cependant, de son côté, Jack Bristow planifie minutieusement une rencontre avec un vieil ami, mais ce rendez-vous secret pourrait s'avérer mortel. Michael Vaughn, quant à lui, découvre des secrets fort dérangeants concernant son propre père...