Don et Charlie enquêtent de conserve sur un cas délicat de terrorisme, ce qui les conduit à confronter des opinions très personnelles sur le sujet. Deux enlèvements par un groupe armé ont conduit le FBI sur la piste d'une organisation humanitaire pakistanaise qui serait une cellule terroriste. Un scientifique, ami de Charlie, est arrêté, ce qui place ce dernier en porte-à-faux avec le FBI et lui pose un cas de conscience lorsque ses théories prouvent l'innocence de ce suspect. Comme il continue de défendre son ami, son frère lui apprend qu'il risque de voir sa collaboration avec le FBI suspendue...