L'équipe du NCIS enquête sur la mort d'un soldat afghan, installé aux Etats-Unis pour une période d'entraînement intensif. Deux autres soldats afghans, conviés sur le sol américain pour les mêmes raisons, sont bientôt portés disparus. Callen et ses acolytes doivent à tout prix retrouver les deux hommes avant qu'ils ne révèlent des informations confidentielles à leurs ravisseurs. Pendant ce temps, remis de ses blessures, Sam annonce son retour au bureau. Ses collègues se demandent si ce n'est pas un peu prématuré. Callen, lui, réalise qu'il a peu de points communs avec son partenaire...