Un aumônier de marine, pasteur à l'église baptiste de Clearwater, a été assassiné. Le NCIS soupçonne tout d'abord un criminel, membre d'un gang local. L'homme a été vu en compagnie de la victime la veille de sa mort. Parallèlement, Pride pense avoir trouvé une connexion entre le maire Hamilton et les activités illégales qui gangrènent la ville. Des opérations immobilières illégales aurait permis à l'élu de s'enrichir. Il aurait acheté des propriétés en utilisant une société écran. Des familles pauvres aurait été écartées de ces quartiers. Percy, de son côté, continue de faire face aux conséquences de ses décisions dans une ancienne affaire : elle se retrouve en prison...