Un officier en permission est renversé par un taxi après avoir eu un comportement étrange lors de la soirée. L'autopsie du docteur Loretta Wade révèle alors que l'homme est mort de la peste bubonique, mortelle et très contagieuse. Pour empêcher le virus de se propager et trouver son origine, Pride va bénéficier de l'aide de l'agent Tony DiNozzo, qui a développé une tolérance à la peste après l'avoir contractée dix ans plus tôt...