Au cours d'un exercice organisé conjointement en mer pour les gardes-côtes et l'équipe du NCIS, Gibbs et l'agent Borin découvrent un cadavre dans les flots. Il s'avère qu'il s'agit d'un membre d'équipage du cargo Dominick. L'homme avait été porté disparu à soixante miles nautiques de leur embarcation. Les gardes-côtes et Gibbs montent à bord du bateau pour rencontrer l'équipage et tenter d'en savoir davantage. L'accueil que leur réservent le capitaine Tom O'Rourke, qui a survécu à une récente attaque de pirates, et son second, James Meyer, est pour le moins glacial. Les deux hommes ne semblent guère décidés à coopérer...