Grâce à l'arme des Anciens, les Réplicateurs ont été anéantis. Mais Anubis ne renonce pas à réaliser son grand dessein : faire de l'univers un désert sans vie. Pendant que les Jaffas, enfin libres, rassemblent leurs forces et se préparent à affronter les troupes d'Anubis répliées sur Tartarus, Daniel amorce à nouveau son processus d'ascension. Il retrouve Oma Desala et rencontre un certain Jim, avec lequel il a de longues discussions. Sur Tartarus, les Jaffas comprennent qu'ils sont tombés dans un piège tendu par leur ennemi : la planète est déserte et Anubis détient l'arme absolue. Le sort de la galaxie repose sur Daniel, toujours occupé avec Oma et Jim...