De la découverte de la Cité perdue naîtra le salut et la victoire de la Terre sur la puissance malfaisante d'Anubis, qui disposera bientôt d'une armée invincible. Le temps étant compté, le général Hammond donne le feu vert à une nouvelle mission de SG-1, qui doit rapporter de la planète P3X439 une bibliothèque de connaissances. Les informations qu'elle contient permettront de localiser la fameuse cité. Hammond ignore encore que le vice-président Kinsey a prévu de le relever de ses fonctions pour le remplacer par le docteur Elizabeth Weir, éminente spécialiste en sciences politiques. La jeune femme n'a cependant pas l'intention de se laisser manipuler par Kinsey...