Pride est contacté par un ancien collègue de l'US Navy qui a été victime d'un guet-apens. Souhaitant faire toute la lumière sur cette opération militaire qui a mal tourné, Pride veut comprendre ce qui est arrivé à ce capitaine pourtant aguerri. Le chef du NCIS se rend sur les lieux de l'intervention, dans une région reculée d'Amérique du Sud. Sebastian et Tammy l'épaulent. Les choses se compliquent rapidement car l'affaire est classée secret défense et n'a officiellement pas eu lieu. De son côté, Sonja s'interroge sur son avenir professionnel...