La police découvre le cadavre d'un parrain de la mafia irlandaise. Ce truand avait de nombreux ennemis. Qui a commandité sa mort ? Castle et Beckett sont chargés de l'enquête. Ils découvrent rapidement que ce qui ressemblait à première vue à un crime crapuleux est en fait un règlement de comptes dans le cadre d'une véritable guerre des chefs. Le contrôle d'un territoire est en jeu. Castle comprend qu'une importante opération de trafic de drogue se prépare dans le secteur convoité. L'enquête prend une tournure beaucoup plus personnelle lorsque Beckett découvre que l'assassin du parrain pourrait bien être aussi le meurtrier de sa mère...