Scully, qui a accouché, est en congé de maternité pour quelques temps. Mulder apprend qu'il a été démis de ses fonctions au sein du bureau des affaires non-classées. Doggett se voit aussitôt attribuer une nouvelle partenaire, une dénommée Leyla Harrison, qui est fascinée par les dossiers non résolus et a suivi en détail la carrière des agents Mulder et Scully. Tous les deux sont rapidement confrontés à un cas étrange : un meurtre a été commis, et le principal suspect pourrait bien ne pas être humain. C'est alors que Mulder, qui ne devrait pas intervenir dans une enquête officielle, décide de leur donner un coup de main...