Malgré le refus catégorique de O'Neill, Daniel embarque à bord du Prométhée sur les ordres du général Hammond, déterminé à partir à la recherche de la mission Atlantis. Au cours du voyage, l'appareil croise un Alkesh abandonné et intercepte un message de détresse lancé par une femme, en provenance du navire à bord duquel un terrible affrontement avec les Jaffas a fait rage. Le général envoie une patrouille de reconnaissance. Mais les hommes sont trompés par Vala, une guerrière Kull qui parvient à infiltrer le Prométhée. Celle-ci vide le vaisseau de son équipage, désormais prisonnier de l'épave. Vala se retrouve alors seule avec Daniel, resté à bord...