Pour rester en vie, Jack O'Neill a accepté de recevoir un symbiote Tok'ra dénommé Kanan. Or, dès que Kanan a été implanté, il a pris possession de l'esprit de Jack et s'est enfui par la Porte des étoiles. Au moment où Jack/Kanan tente de secourir une femme sur une lointaine planète, il est abattu par des Jaffas. Kanan s'extrait du corps de Jack et disparaît. Sans aucun souvenirs, Jack se retrouve prisonnier de Ba'al, qui le torture pour connaître les raisons qui l'ont amené dans sa base secrète. Dans sa cellule, Jack voit apparaître Daniel Jackson, venu le soutenir dans cette épreuve. Au SGC, une mission de secours s'organise...