Le Dédale remporte tant bien que mal la bataille contre les deux vaisseaux ruches tandis que Sheppard, dont le F302 a été attaqué, échappe de justesse à la mort. Il décide d'entreprendre une mission pour libérer McKay et Ronon, qui sont emprisonnés par les Wraith. Il reçoit l'aide inattendue de Michael, rejeté par les siens parce qu'il a été contaminé. Dans le même temps, Weir rentre du SGC et tente de mettre en place un plan d'attaque afin d'empêcher les vaisseaux ruches Wraith d'arriver sur Terre...