Lors de l'inspection d'Atlantis, Sheppard, Ford et Teyla découvrent le corps d'une femme, en état de stase depuis 10 000 ans. A son réveil, ils apprennent, stupéfaits, qu'il s'agit du docteur Weir. Après le premier débarquement, qui avait échoué, et l'évacuation forcée d'Atlantis, Weir s'était retrouvée à bord d'une machine à voyager dans le temps. Elle s'était ensuite réveillée cent siècles plus tôt dans la même cité occupée par les Atlantes, où elle avait rencontré le conseil des Anciens...