Grâce aux technologies "hasgardes" d'Hermione et à l'assistance du Dédale du Colonel Cadwell, Sheppard est sauvé et le bouclier protecteur d'Atlantis est activé avec succès. Mais la bataille n'est pas terminée car d'autres vaisseaux Wraith sont en approche. Teila et Ford, portés disparus, sont maintenant hors de danger ; excepté Ford, dont l'organisme est fortement perturbé par l'ennemi...