Lex est à la poursuite d'une entité extraterrestre issue de la Zone Fantôme, dont l'ADN lui est indispensable pour mener à bien le projet Ares. De son côté, Lana décide de quitter Lex et annonce la nouvelle à Clark, qui lui avoue sa véritable identité. Pendant ce temps, Lois étudie une liste de chiffres que Wes lui a donné avant de mourir. Elle en déduit qu'il s'agit de la zone 33.1 et se rend sur les lieux. Clark interroge Lionel sur les vraies raisons qui ont poussé Lana à épouser Lex lorsque l'alien fait son apparition. Clark est alors confronté à son pire ennemi : Bizarro, son clone, mais dont les pouvoirs sont inversés...