Des restes humains sont découverts dans une cuvette de toilettes. L'identification est rendue possible grâce à un implant oculaire : il s'agit d'un fugitif. L'homme, condamné pour avoir escroqué des milliers d'épargnants, s'est échappé d'un pénitencier fédéral quelques mois plus tôt. Cependant, en remontant les canalisations, l'équipe comprend rapidement que l'homme a été tué au sein même de la prison et doit alors déterminer, parmi ses nombreux ennemis, qui aurait pu l'éliminer. Brennan, au terme de sa grossesse, souhaite accoucher à domicile, contre l'avis de Booth...