Dans l'océan Pacifique, un navire de recherche français retrouve l'épave d'un avion de la Seconde Guerre mondiale. Gauthier, un plongeur, examine la carlingue de l'appareil et aperçoit le corps du pilote resté prisonnier de l'appareil. De retour à terre, tous les membres de l'expédition meurent, gravement irradiés. Tous ? Non. Curieusement, Gauthier est le seul à survivre. Pendant que Mulder enquête sur la société de recherche, Scully interroge un vétéran de l'armée chargé à l'époque de retrouver l'avion abîmé en mer...