1989. Une pluie de météorites s'abat sur Smallville au Kansas, semant la panique dans les rues de la paisible communauté et faisant de nombreuses victimes. Ce jour-là Jonathan et Martha Kent, un couple de fermiers en mal d'enfant, découvrent dans un champs de mais, près d'un vaisseau spatial calciné, un petit garçon nu qu'ils décident aussitôt d'adopter et qu'ils prénomment Clark. Douze années ont passé. Clark est devenu un adolescent séduisant qui mène la vie d'un lycéen sans histoires. Pourtant le teenager est complexé. Doté de mystérieux pouvoirs qu'il ne maîtrise pas, Il n'accepte ni ne comprend ses différences. Ses parents lui ayant toujours caché le mystère de ses origines...