Dans un hangar de l'armée, Olivia, Broyles, Walter et Peter rencontrent Nina Sharps et le docteur James Falcon. Grâce aux informations laissées par l'autre Olivia, des scientifiques ont réussi à reconstituer la machine dont Peter semble être la clé. La seule présence de Peter active l'étrange construction. Walter demande à Nina de l'aider à comprendre la relation qui unit son fils à la machine. Le docteur Falcon est chargé de faire subir des tests à Peter. Mais l'équipe va bientôt être chargée de résoudre une affaire de meurtre, dont la victime est un polymorphe...