Dennis Ryland et d'autres membres du gouvernement doivent comparaître au tribunal afin d'être jugés. On leur reproche d'avoir dissimulé des informations capitales concernant les 4400. Soudain, un bruit inquiétant vient perturber l'audience. Kim, jugée responsable de cette interruption, est sommée de s'expliquer. De leur côté, Richard et Lily doivent faire face à Isabelle, qui est devenue une jeune femme. Dans le même temps, Lily est touchée par une maladie qui semble la faire vieillir de façon accélérée. Malgré ses efforts, Shawn ne peut pas arrêter le processus à l'issue dramatique. Une nouvelle organisation, le groupe Nova, fait alors son apparition...