Jeune fille joviale de 10 ans, Sakura Kinomoto vit avec son père, professeur d'archéologie, et son grand frère, Toya, depuis que sa mère est tragiquement décédée. Son quotidien bascule le jour où, en rentrant de l'école, elle découvre dans le sous-sol de la bibliothèque un mystérieux livre contenant les Clow Cards s'envolant aux quatre vents. La Bête du Sceau, Kerberos, la charge alors de réunir l'ensemble des cartes.