Scott s'inquiète pour Chloe, qui a un comportement de plus en plus étrange. En lisant son journal intime, il découvre qu'elle écrit en ancien. Elle aurait subi une manipulation génétique par les aliens qui la transformerait petit à petit en l'une des leurs. Rush profite de la situation pour lui faire déchiffrer des équations. De son côté, Eli utilise les pierres de communication pour rendre visite à sa mère, mourante...