Un avion furtif équipé d'un dispositif anti-radar top secret s'est écrasé en Bosnie. Les agents de l'équipe Scorpion sont envoyés en mission sur place pour récupérer ce logiciel d'avant-garde, avant qu'il ne tombe aux mains des rebelles. Ils sont également accompagnés par des militaires, chargés de rapatrier le corps du pilote. De son côté, Sylvester fait la connaissance de Megan, la soeur de Walter, qui bénéficie d'une petite pause dans le déroulement de son traitement. Ils passent du temps ensemble au garage...