Envoyée à New York en 1780, l'équipe se retrouve au milieu de la guerre d'Indépendance, le jour où Benedict Arnold doit céder West Point à l'armée britannique. Cependant, grâce à la clé des Barrow, Flynn trouve une preuve qui lui permet de remonter jusqu'à l'un des membres fondateurs de Rittenhouse. Il décide de convaincre Wyatt, Rufus et Lucy d'allier leurs forces afin de détruire cette organisation...