En 2015, Natalia Verdugo, directrice adjointe de Monarch, se montre irritée en découvrant que Shaw a dissimulé à Cate, Kentaro et May les activités d'Hiroshi en Alaska. Duvall propose alors de relâcher les trois afin de pouvoir surveiller leurs déplacements. De retour à San Francisco, Cate persuade sa mère, Caroline, ainsi que son collègue James, de les aider à pénétrer clandestinement dans le bureau d'Hiroshi, situé dans une zone interdite des ruines de la ville. Après avoir échappé aux patrouilles militaires et affronté les séquelles du stress post-traumatique de Cate, le groupe parvient finalement au bureau...