A Kiel, en Allemagne, la Kriegsmarine fait tout pour entretenir une image forte, en accueillant la Marine impériale japonaise notamment. Dans un U-Boot flambant neuf, le commandant Ehrenberg, de retour en service à bord d'un sous-marin, fait la connaissance du jeune officier, Franz Buchner, qui s'est vu confier le commandement du submersible. Mais son manque d'assurance et d'expérience en font une cible facile pour les sous-mariniers à bord. Et alors qu'ils doivent rejoindre la bataille de l'Atlantique, il finit par se faire épauler par Ehrenberg. La bande originale de la saison 3 a été récompensée aux 13e Hollywood Music in Media Awards. Hoffmann suit Weiss dans un entrepôt où il récupère de précieuses informations. Il découvre que son père, Wilhelm, est à Lisbonne pour une séance de dédicace et veut le voir. Forster intervient et c'est finalement Ines qui entre en contact avec lui. Le U-949 subit une lourde attaque du HMS Perseverance. Le commandant Buchner met en place une stratégie risquée pour combattre le destroyer.