Suite à la mort de Nick et à la disparition de Connor et Abby dans le Crétacé, le Centre de Recherche des Anomalies est dirigé par une nouvelle équipe avec à sa tête Matt, qui cache un secret au sujet des anomalies. Grâce à Helen, Abby et Connor reviennent dans le présent, mais ils sont suivis par un Spinosaurus géant, le plus grand dinosaure carnivore connu au monde. Ils vont bientôt s'apercevoir que le Centre a été repris par des hommes d'affaires et qu'ils risquent d'être mis hors jeu...