Dans l'archipel Revillagigedo, à 400 km au sud de Baja, sur la côte californienne, l'équipe des hommes-requins est à nouveau sur le pont, prête à lever l'ancre. Pourtant, tout a changé. Des nouvelles recrues dans le pôle scientifique de l'équipe, de nouvelles espèces de requins à protéger, de nouvelles méthodes pour attraper les requins... L'équipe emmenée par Chris et le Docteur Hammerhead s'est fixé l'objectif d'étiqueter 5 requins de chaque espèce vivant dans ces eaux. Grâce à ce procédé, ils permettront à la communauté scientifique d'en savoir un peu plus sur le comportement et les déplacements des requins tigres, des requins des Galapagos, et beaucoup d'autres.