Au ministère de la Défense, un homme invisible subtilise un dossier secret sous les yeux d'un fonctionnaire ébahi. Emma et Steed se rendent sur les lieux, sans vraiment croire à cette histoire délirante. Mais une fois arrivés sur place, ils voient le dossier 144 s'envoler à leur nez et à leur barbe. Le dossier les mène rapidement sur la piste de Quilby, un savant fou qui leur révèle sa fabuleuse découverte, la formule de l'invisibilité. L'inventeur leur fait également une autre révélation, plus inquiétante : il a vendu la formule à la «Compagnie de l'Est», une société fantôme. Emma et Steed tentent d'en savoir plus sur cette mystérieuse organisation...