Avec ses hybrides, Michael réussit à s'emparer de la salle de contrôle d'Atlantis. Il active un champ de protection afin d'empêcher quiconque d'atteindre la salle de la Porte des étoiles. Il souhaite à tout prix récupérer Torren, le bébé de Teyla, avant d'enclencher l'autodestruction de la cité. Sheppard organise un assaut de la salle de contrôle. De son côté, Ronon découvre qu'il est enfermé dans une autre pièce...