Baby Boss mène sa famille, les Templeton, par le bout du nez. Adorable petit bébé en apparence, c'est un «homme d'affaire» redoutable en costume. Il propose à son grand frère, Tim, de l'accompagner au bureau, afin de lui montrer les ficelles du métier. Baby Corp est une entreprise qui s'assure de faire en sorte que le monde continue à aimer les bébés plus que les chiots et les chatons. Baby Boss doit régler un nouveau problème, dans un quartier où l'on aime pas les bébés, notamment à cause du «pire bébé du monde» qui casse les oreilles de tout le voisinage...