Cette fois, c'est à Venise que l'alerte est donnée. La vénérable Cité des doges est la proie d'une invasion de méduses extrêmement dangereuses. La biologiste Cécile Roche identifie la bactérie qui contamine les hommes via les fruits de mer et comprend deux choses : c'est une bactérie qui a muté et elle est désormais passée dans le réseau de distribution d'eau. Pendant ce temps, la meilleure amie de Charlie Wagner disparaît avec son navire de recherche sans laisser de traces. Au Canada, le chercheur Leon Anawak essaie de comprendre les raisons des attaques de baleines. Les moules qu'il a prélevées sur le Barrier Queen produisent une substance étrange, la même qui a retrouvée dans le tronc cérébral de l'orque échouée...