En 1588, à Lisbonne, un agent du Ministère du Temps, Gil Perez, signale une nouvelle menace sous le règne de Philippe II, lorsqu'il découvre que le futur grand écrivain, Lope de Vega, n'est pas monté à bord de l'Armada, l'une des rares nefs à ne pas avoir sombré à l'époque. Lope de Vega s'apprête au contraire à embarquer sur l'un des navires voué au naufrage. Julián, Alonso et Amelia se rendent immédiatement à Lisbonne afin que l'Espagne ne soit pas privée de ses écrits littéraires les plus mémorables. Les trois agents vont faire de nouvelles découvertes au cours de ce périple...