Un jeune homme syrien arrive à l'Hôpital Central d'Atlanta avec les symptômes d'une forte grippe. Il est examiné par le docteur Sanders, puis rentre chez lui. Celle-ci développe les mêmes symptômes très peu de temps après. Elle est tout de suite mise en isolement dans l'Unité des Maladies Infectieuses et prise en charge par le docteur Cannerts. Son cas est signalé aux autorités sanitaires et pris très au sérieux par le gouvernement, qui soupçonne une attaque bioterroriste. Toute la ville est alors mise en quarantaine par le gouvernement. L'officier de police Lex Carnahan tente d'empêcher la cité de sombrer dans le chaos...