Nos héros se sont détournés de leur route vers Flusselles, pour aller visiter l'unique usine de Poké Balls au monde ! Les trois dirigeants de l'usine leur paraissent étrangement familiers... c'est la Team Rocket, bien entendu ! Et au moment où ils le comprennent, nos héros ont déjà enfermé leurs Pokémon dans les Poké Balls et se retrouvent eux-mêmes prisonniers dans un local de rangement. Mais Pikachu s'échappe et une terrible poursuite s'ensuit quand il cherche à récupérer la mallette où sont rangées les Poké Balls. Miaouss essaie de capturer Pikachu dans sa propre Poké Ball, mais Pikachu arrive à s'enfuir !