Arthur Brown, le Maître des Indices, s'échappe du pénitencier de Blackgate, cinq ans après que Sophie l'y a envoyé. Afin de se venger, il organise une nouvelle énigme qu'elle doit résoudre avec l'aide de Mary et Ryan dans le but de sauver une personne qu'il a empoisonnée : Stephanie Brown, sa propre fille. De son côté, Alice est aux mains de Black Mask et Circe qui tentent de lui faire avouer le véritable nom de Batwoman. Pendant ce temps, Jacob continue de revisiter son passé...