Mienumon profite de la mise en ligne d'un nouveau système d'exploitation pour infecter tous les smartphones. Tous deviennent inutilisables, créant le chaos. Haru et Gatchmon, aidés de leurs amis, vont devoir se rendre à la surface du Web pour vaincre l'armée de Virusmon. Mais dans cet espace, ils sont tous constitués de données, et peuvent donc facilement être infectés par le virus...