Van, Hitomi et Allen sont emportés par une colonne de lumière, au coeur même de l'empire Zailbacher, dans la citadelle de Dornkirk. Ici, ils apprennent que Dornkirk a entrepris de reconstruire la machine à manipuler le destin qui a détruit Atlantis et que Zaibacher a besoin du pouvoir d'Escaflowne pour mener cette mission à terme.