Dans un futur proche, les espèces humaines et mutantes ont été éliminées de la surface du globe par d'impitoyables robots, les sentinelles. Les rares survivants des deux camps n'ont plus foi en l'avenir. Dans un ultime effort pour changer le cours tragique des événements, le professeur Xavier et Magnéto, autrefois ennemis et devenus amis, envoient Wolverine dans le passé, à la rencontre des jeunes mutants qu'ils ont été. Car le meilleur moyen d'arrêter la guerre reste encore de ne pas la laisser éclater. Le mutant aux griffes d'acier va donc user de tout son talent de «diplomate» pour enterrer la hache de guerre entre les frères ennemis...