Quatorze siècles avant J.-C., en Egypte. Sinouhé, le fils adoptif d'un médecin des pauvres, et son ami, le guerrier Horemheb, sauvent le fils du pharaon, Akhénaton. En récompense, Sinouhé est nommé médecin personnel du souverain et Horemheb entre dans la garde impériale. Trois femmes gravitent autour de Sinouhé ; elles joueront un rôle capital dans sa vie. Il y a Mérit, l'esclave, qui l'aime d'un amour sincère, Bakétamon, la noble intrigante, et Néfer, une prostituée. Ruiné par une conspiration, Sinouhé doit s'exiler. Le temps passe. Il rentre à Thèbes où il est gracié. Face à l'incapacité d'Akhénaton à gérer l'économie du pays, Horemheb tente de s'emparer du pouvoir.