L'agent secret Austin Powers excelle dans l'art de séduire et de combler les femmes. Son secret : le «Mojo», une essence aux vertus aphrodisiaques avérées. Le docteur Denfer, son ennemi juré, parvient à dérober cette substance miraculeuse et à prendre la fuite à bord de sa machine à remonter le temps. Sans attendre, Austin Powers se lance à sa poursuite, accompagné de sa fidèle et plantureuse assistante, Felicity Bonnebez. Il s'emploie à contrecarrer les projets mégalomaniaques de son rival. Celui-ci s'adjoint les services d'un clone miniaturisé, aussi bête et méchant que son modèle. Austin Powers doit choisir entre sauver Felicity et récupérer le précieux «Mojo»...