Supergirl fait sa rentrée au collège des super-héros. Maladroite, la jeune fille a encore du mal à maîtriser ses pouvoirs. Barbara Gordon va lui prodiguer des conseils et l'entrainer, avec l'appui de toutes les autres super-héroïnes. Pendant ce temps, une super-vilaine tente de prendre possession de Tubes Boum pour pouvoir lancer une attaque et contrôler Metropolis...